Antes de hablar de las aplicaciones Web 2.0, quiero que conozcas la existencia de Educarm Clic, portal  de la Consejería de Educación y Cultura de la Región de Murcia, donde puedes encontrar una recopilación de todos los proyecto de JClic.
Los proyectos están organizados en etapas, ciclos y áreas. Es una gran colección de materiales listos para usar en el aula. Se pueden descargar como un archivo exe ejecutable o comprimido en rar. Para bajar Jclic y todos sus componentes, pincha aquí.

En cuanto a las aplicaciones y recursos Web, hay que decir que Webware realizo una encuesta entre los lectores y usuarios del sitio, para saber cuales eran las mejores aplicaciones online o 2.0 de la actualidad. Estas son las cien mejores aplicaciones Web 2.0 del año 2008. Las aplicaciones fueron clasificadas en navegación, comunicaciones, comunidades, datos, entretenimiento, multimedia, móvil, productividad y comercio, publicación e información. Ciber Geek hizo la lista.
 

También ZaidLearn en A Free Learning Tool for Every Learning Problem? ha realizado un listado de más de 120 aplicaciones recomendadas para el aprendizaje. El caparazón lo ha difundido como un directorio excepcional. Existe un sitio gratuito para cada necesidad o experiencia de aprendizaje:

Así, si lo que quieres es un…

1. Explorador de internet de fácil utilización: Firefox

2. Sistema de gestión de correo: Gmail

3. Sistema de marcaje social (compartir favoritos): del.icio.us

4. Traductores online de textos o páginas web: Google Language Tools

5. Lectores RSS: Google Reader.

6. Calendarios online: Google Calendar

7. Una herramienta que agregue todos tus recursos (mail, RSS feeds) en un solo sitio: iGoogle

8. Escritorio virtual, PLE o plataforma en la que integrar tus herramientas favoritas en un solo sitio: Elgg

9. Learning Management System (plataforma para elearning) fácil: Moodle

10. LMS gratuitos donde alojar nuestros cursos: Nfomedia, Edu2.0, MyiCourse, LectureShare, eLearning Community 2.0 (Puede integrar interesantes servicios de escritorio virtual compartido como WiZiQ o DimDim) EctoChalksite ¿Una herramienta que te ayude a valorar el LMS o CMS más conveniente? EduTools

11. ¿Un gestor de acLearning Activity Management System? LAMS

12. Herramienta colaborativa: Ning

13. Red social: Facebook.

14. Un mundo paralelo, una realidad online virtual donde socializarse, conectar y aprender: Second Life

15. Una clase virtual, un escritorio compartido (al estilo Eluminate pero libre): DimDim

16. Una clase virtual alojada en un servidor WiZiQ

17. Una herramienta para emitir, con posibilidad de interactividad, en directo, tus charlas? USTREAM

18. Realizar llamadas desde el ordenador: Skype

19. Servicio de chat con videoconferencia Vawkr

20. Herramientas de creación de contenidos de autor: eXe & CourseLab

21. ¿Alternativas a Microsoft Office? OpenOffice

22. Herramientas online para compartir documentos de “office”: Google Docs o Zoho

23. Herramienta de gestión de blogs: WordPress.

24. ¿Microblogging? Twitter

25. ¿Un directorio de edubloggers en cualquier lugar del mundo? International Edubloggers Directory

26. Wiki: PBwiki

27. Una enciclopedia: Wikipedia

28. Una herramienta de gestión de Audio: Audacity

29. Un lugar en el que almacenar grabaciones de audio: Odeo

30. Una herramienta para transformar distitnos medios en espacios colaborativos con video, voz y texto: VoiceThread

31. Herramientas para contar historias: Muchas…en este enlace hay 50!

32. Una herramienta de grabación de Screencasts (*disculpa Camtasia mi temporal infidelidad…;)) Wink

33. Una herramienta online de creación de screencasts: Jing

34. Creación de mapas mentales: FreeMind

35. Realizar múltiples capturas de pantalla desde distintos navegadores: Browsershots

36. Software de autor 3D de fácil utilización Google SketchUp

37. Redimensionador de imágenes: Dosize

38. Marcas de agua: uMark

39. Selectores de color ColorSchemer

40. Herramienta para resaltar texto en una página web: The Awesome Highlighter

41. Diagramas, diagramas de flujo, dibujos técnicos: Gliffy

42. Imágenes personalizadas: Custom Sign Generator Widgets

43. Herramientas para crear cómics: ToonDoo

44. Sitios para crear un website propio: Webnode

45. Herramienta para crear Pdfs (Windows) PDFCreator

46. Para compartir slides, presentaciones, diapositivas: SlideShare

47. Una herramienta para compartir videos: YouTube

48. Un portal en el que compartir o consultar sobre investigación científica: SciVee

49. Una comunidad online en la que compartir y discutir sobre videotutoriales: TeacherTube

50. Comunidad online para compartir ideas y aprender sobre usos educativos de las NNTTs: EdTechTalk

51. Comunidad online en la que compartir grandes ideas: Big Think

52. Herramienta para descargar videos de cualquier plataforma (YouTube, Metacafe, etc.): ClipNabber

53. Herramienta de autopublicación de artículos, libros: Scribd

54. Herramienta para compartir fotos: evidentemente… Flickr

55. Solución de hosting para compartir archivos de más de 250Mb: FileCrunch

56. ¿Cuestionarios online? ClassMarker

57. Herramienta para crear ejercicios interactivos, ampliamente utilizada en educación: Hot Potatoes

58. Herramienta para crear encuestas online: Polldaddy

59. Herramienta para crear juegos en flash(plantillas): ClassTools.net

60. Juego que simula inversiones: Virtual Trader

61. Herramienta 3d para simular negocios: INNOV8

62. Juego para entender el método científico y las destrezas del siglo XXI (21st Century Skills): River City

63. Juego para entender la gestión de una ciudad: SimCity

64. Juego para entender sobre cuestiones sociales: Quest Atlantis

65. Juego para entender el hambre en el mundo y los esfuerzos por aliviarla: WFP Foodforce

66. Juego para aprender más vocabulario y a la vez participar en una causa social contra el hambre: FreeRice

67. Herramienta para crear un buscador propio, personalizado: Google Custom Search Engine

68. Motor de búsqueda humano: Mahalo

69. Metabuscador visual: KartOO!

70. Motor de búsqueda que agrupe los resultados por tópicos mediante tecnología automática de clusters: Vivisimo

71. Buscador específico para cuestiones científicas: Scirus

72. Buscador todo en uno de investigaciones: Schoolr

73. Herramienta para buscar, descubrir y comparar por ranking distintos sitios a nivel mundial: Alexa

74. Herramienta para buscar textos completos en libros: Google Book Search

75. Herramienta de búsqueda de literatura “escolar”: Google Scholar

76. Herramienta de búsqueda de patentes:Google Patent Search

77. Buscador que ahorra energía: Blackle

78. Diccionario y thesaurus visual y online: Visuwords

79. Librería digital virtual: World Digital Library

80. Herramienta para construir y distribuir mi propia librería digital: Greenstone

81. Lugar en el que encontrar cursos libres, Open course Ware (OCW): OpenCourseWare Consortium

82. Repositorio y red de aprendizaje de Open educational resources: OER Commons

83. Lugar en el que conocer las últimas novedades en OER y OCW: OER Blogs

84. Enciclopedia de videotutoriales para aprender sobre cualquier software: Wikivid (Illasaron es la más extensa, en mi opinión, en el ámbito hispano)

85. e-Book para aprender sobre e-learning 2.0? Learning 2.0 eBook y el wiki de El caparazón.

86. Sitio dónde aprender sobre eleraning rápido: The Rapid e-Learning Blog

87. Site en que sobre desarrollo de cursos online: Hitchhiker’s Guide to Course Development

88. Repositorio de indeas creativas y herramientas para el pensamiento crítico: Mycoted to the rescue!

89. El camino para aprender más sobre habilidades para el S. XXI Route 21

90. Repositorio sobre cómo funciona cualquier cosa: HowStuffWorks

91. Repositorio de lectura de los científicos más famosos: Videolectures.NET

92. Directorio de repositorios académicos libres: OpenDOAR

93. Juego útil para aprender sobre nuevas tecnologías: ReviseICT.co.uk

94. Curso para mejorar la escritura Peter’s Online Typing Course

95. Herramienta para la visualización en 3d de la anatomía humana: Visible Body

96. Herramienta para el aprendizaje de idiomas: Mango

97. Herramienta para explorar el mundo: Google Earth

98. Herramienta para explorar el universo: WorldWide Telescope

99. Herramienta para observar el desarrollo humano: Gapminder

100. Plataforma de respuesta a nuestras dudas: Answer.com

101. Sitio con charlas de los pensadores más importantes del mundo: TED es un buen punto de partida.

102. El laboratorio 2.0 y 3.0 más innovador en el mundo: Google Labs

103. Herramienta para descubrir fantásticos sitios, videos, fotos (especialmente recomendado para netart): StumbleUpon

104. Sitio en inglés en el que descubrir nuevas herramientas, el lugar de la autora original de este listado en delicious, ZaidLearn’s Del.icio.us Discoveries.